W przypadku przedsiębiorców, którzy mają obowiązek opłacania podatku VAT, ulgę odejmuje się od podatku do zapłaty. W danym okresie nie można jednak odjąć więcej, niż wynosi wysokość należnego VAT. Ewentualna pozostała część możliwa jest do rozliczenia w następnym okresie (aż do pełnego odliczenia). Odliczenia ulgi można dokonać w rozliczeniu za okres, w którym rozpoczęto ewidencjonowanie, lub w kolejnych okresach. W praktyce oznacza to że ulgę można odliczyć w dowolnym momencie, ponieważ przepisy nie określają końcowego terminu, po którym przedsiębiorca traci do niej prawo.